Как перевести снимки мрт в формат dicom

Сразу хочу оговориться – скорее всего, данная статья будет интересна и полезна очень небольшому кругу людей. А именно, тем кто делал МРТ (Магнитно-резонансная томография) или КТ (компьютерная томография) и получил результат на носителе (диск, флешка)

Итак, для начала, давайте разберемся, что такое формат DICOM?

DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine) — медицинский отраслевой стандарт создания, хранения, передачи и визуализации цифровых медицинских изображений и документов обследованных пациентов.

Некоторые ошибочно полагают, что данный файл хранит только рентгеновские снимки и результаты компьютерной томографии. На самом деле, данный формат может хранить результаты бесчисленного множества медицинских обследований. Таких как: рентгенография, микроскопия, эндоскопия, электрокардиография, записи шумов работы сердца, электроэнцефалограмма и т.п. В США этот формат используют в сфере образования для подготовки врачей. С помощью них делаются 3D-атласы анатомии и т. п.

Предыстория, почему я решил написать данную статью.

Довелось мне работать в одной поликлинике, которая обслуживала весь район (район не города, а несколько населенных пунктов). И вёл я там приём за хирурга, детского хирурга и травматолога. По классике жанра, в поликлинике сломался рентген – аппарат. У нас была договоренность с другой поликлиникой, куда мы отправляли наших пациентов для проведения данного вида обследования. А оттуда люди шли к нам с CD дисками, где были результаты обследования (рентген снимки на руки не отдавали потому, что их не делали). И вот, идут люди ко мне с этими дисками, а я только и могу, как Ирина Аллегрова «развести руками», ибо смотреть их было не на чем. Конечно, у наших рентгенологов (сломался же аппарат, а не рентгенологи) была возможность просмотреть эти данные. Должен отметить, что я не специалист по рентгенодиагностике, но рассматривание рентген-снимков несколько раз позволило мне принять верное решение в тактике лечения. Поэтому я задумался, что лучше иметь у себя возможность просмотреть эти файлы. Понятное дело, что в лечебном учреждении нежелательно использовать «пиратское» ПО, а на платное денег нет.

Я бы хотел остановиться на двух приемлемых для работы программах (на самом деле, их очень большое множество, ведь формат DICOM считается открытым и поэтому проблем разработки ПО для работы с ним нет).

Чем открыть файл DICOM

Первая программа имеется в репозитории Ubuntu. Называется она Aeskulap Viewer.

Интерфейс программы не перегружен функционалом, но главное: со своей функцией она справляется очень хорошо. На ней мне удалось просмотреть рентген – снимки и компьютерные томографии (несколько послойных снимков – «срезов»). Программа всё открыла без нареканий.

Для установки этой программы вам достаточно выполнить в терминале команду:

sudo apt-get install aeskulap

Вторая программа, про которую хотелось бы упомянуть, называется Aliza. У данной программы уже более серьёзный интерфейс и она имеет, так называемый DICOM Browser, с которым открытие файлов более удобное.

При открытии компьютерной томограммы, Aliza на основе данных построила для наглядности 3D-макет исследуемого участка.

Для установки этой программы вам потребуется скачать её с официального сайта. https://www.aliza-dicom-viewer.com/home

Данные программы не являются сертифицированными для основного использования. Они могут использоваться как дополнительные или в учебных целях. Более профессиональные, такие как 3D Slicer, AMIDE, dcm4che, openDICOM.NET, XMedcon, DicomBrowser, kradview, как правило, тоже бесплатные и их использование не должно вызвать каких либо юридических проблем.

Также есть еще InVesalius

и Weasis Medical Viewer

которые также хорошо работают и под Линуксом

В целом, хочу заметить, что программного обеспечения для медицинской сферы под систему Linux довольно много и, самое главное, оно бесплатное. Взять хотя бы такую программу, как электронная «история болезни» для поликлиник GNUmed. Но, к сожалению, многие программы есть пока только на английском языке, вероятно, поэтому они у нас используются не так широко.

Источник: linuxthebest.net

Надрукувати
E-mail

Источник

Studia3D

Загрузка

13.03.2018

16145

Подпишитесь на автора

Подпишитесь на автора, если вам нравятся его публикации. Тогда вы
будете
получать уведомления о его новых постах.

Отписаться от уведомлений вы всегда сможете в профиле автора.

37

Есть несколько программ перевода снимков МРТ или КТ в 3d-модель. Для создания трехмерной модели из снимков формата .dcm мы используем InVesalius. Данная программа не только удобна и проста в применении, также доступна для большинства платформ: Windows, Mac OS и т.п. Программа бесплатна и распространяется в открытом доступе.

После установки и открытия программы мы попадаем в главное меню. Где необходимо загрузить наши исходные снимки DICOM.