Как сделать трехмерную модель из снимков мрт

Как сделать трехмерную модель из снимков мрт thumbnail

Studia3D

Загрузка

13.03.2018

16321

Подпишитесь на автора

Подпишитесь на автора, если вам нравятся его публикации. Тогда вы
будете
получать уведомления о его новых постах.

Отписаться от уведомлений вы всегда сможете в профиле автора.

Подписаться

37

Есть несколько программ перевода снимков МРТ или КТ в 3d-модель. Для создания трехмерной модели из снимков формата .dcm мы используем InVesalius. Данная программа не только удобна и проста в применении, также доступна для большинства платформ: Windows, Mac OS и т.п. Программа бесплатна и распространяется в открытом доступе.

После установки и открытия программы мы попадаем в главное меню. Где необходимо загрузить наши исходные снимки DICOM.

Как сделать трехмерную модель из снимков мрт

Выбираем наш проект и нажимает кнопку «открыть».

Как сделать трехмерную модель из снимков мрт

Ждем процесс загрузки всех изображений.

Как сделать трехмерную модель из снимков мрт

После загрузки выбираем наш проект и нажимаем на кнопку «импорт».

Как сделать трехмерную модель из снимков мрт

Если на Вашем компьютере недостаточно оперативной памяти, программа предложит уменьшить исходное разрешение изображений.

Как сделать трехмерную модель из снимков мрт

После импорта мы увидим окно с изображениями нашей томографии. Во втором окне необходимо будет отрегулировать области, которые мы хотим перенести в 3D-модель.

Как сделать трехмерную модель из снимков мрт

В третьем окне нам необходимо создать новую поверхность.

Как сделать трехмерную модель из снимков мрт

Эта поверхность и будет каркасом нашей будущей модеди. Даем ей название.

Как сделать трехмерную модель из снимков мрт

Как видим в нижнем правом углу появилась наша трехмерная модель.

Как сделать трехмерную модель из снимков мрт

Нам остается пройти в четвертое окно и экспортировать 3D-поверхности.

Как сделать трехмерную модель из снимков мрт

Даем название файлу и сохраняем его.

Как сделать трехмерную модель из снимков мрт

Проверим результат в MeshMixer.

Как сделать трехмерную модель из снимков мрт

Как сделать трехмерную модель из снимков мрт

Как сделать трехмерную модель из снимков мрт

Подпишитесь на автора

Подпишитесь на автора, если вам нравятся его публикации. Тогда вы
будете
получать уведомления о его новых постах.

Отписаться от уведомлений вы всегда сможете в профиле автора.

Подписаться

37

Комментарии к статье

Еще больше интересных постов

Внешний MosFET, улучшение эффективности работы

McPaul

Загрузка

17.07.2020

3371

14

Подпишитесь на автора

Подпишитесь на автора, если вам нравятся его публикации. Тогда вы
будете
получать уведомления о его новых постах.

Отписаться от уведомлений вы всегда сможете в профиле автора.

Подписаться

На тему натолкнула недавно появившаяся статья самодельного внешнего модуля для нагрева стола.

Задумался и решил выявить некоторых «бл…

Подключение TFT24 V1.1 и 12864 к SKR mini E3

trengtor

Загрузка

09.07.2020

1037

1

Подпишитесь на автора

Подпишитесь на автора, если вам нравятся его публикации. Тогда вы
будете
получать уведомления о его новых постах.

Отписаться от уведомлений вы всегда сможете в профиле автора.

Подписаться

У плат плат SKR mini E3 есть одна особенность: единственный разъём EXP1 (IDC10) для подключения к дисплею от Ender 3. Поэтому с подключением некоторых…

Сопла и сопли

dron2402

Загрузка

27.10.2018

34755

216

Подпишитесь на автора

Подпишитесь на автора, если вам нравятся его публикации. Тогда вы
будете
получать уведомления о его новых постах.

Отписаться от уведомлений вы всегда сможете в профиле автора.

Подписаться

Сопли. Кто с ними не сталкивался?!

Сколько раз этот вопрос поднимался. Сколько тем им посвящено.

Сколько советов по…

Источник

CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать, краниопластика

Мы занимаемся быстрым созданием параметрических, твердотельных и высокополигональных 3D-моделей на основе различных медицинских снимков (магнитно-резонансная томография (МРТ), компьютерная томография (КТ) в формате DICOM и другие). Это обратный инжиниринг (реверс инжиниринг), цель которого оцифровка физического объекта для дальнейшего использования.

CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать, краниопластикаmagejpeg_2_5-CR3-300x224CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать

Услуги

  • Создание CAD-моделей по данным КТ/МРТ
  • Создание макетов (физических копий) по данным КТ/МРТ с помощью 3D-печати
  • 3D-моделирование
  • 3D-печать

Области применения CAD-моделей по данным КТ/МРТ

Предоперационная подготовка

Врач может четко спланировать операцию, отработать технику и подобрать инструмент, что позволяет сократить время хирургического вмешательства.

 366119-0c4a4ca8-5caa-11e3-8eb9-1c57f26bd260

Хирургия

Насколько 3D-модели будут соответствовать реальной картине состояния органа человека, настолько адекватной будет ситуация при диагностировании, подборе оптимальной оперативной тактики, проведении виртуальных хирургических и травматологических операций и предсказании возможных последствий.

 CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать

Краниопластика

Цель краниопластики — закрытие дефектов костей черепа, т.е восстановления его целостности после декомпрессивных операций, вдавленных переломов, огнестрельных ранений, а также других патологических процессов. Показания к краниопластике определяются главным образом необходимостью герметизации полости черепа. Сегодня для пластической реконструкции костного дефекта применяют различные виды трансплантантов (ауто-, алло-,  ксенотрансплантанты). После обработки данных КТ или МРТ и получения CAD-модели, врачи могут смоделировать недостающую часть кости, необходимую форму импланта или эндопротеза.

Читайте также:  Мрт при грыже поясничного отдела позвоночника

Пример гнутия пластины

CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать, краниопластика  CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать, краниопластика CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать, краниопластикаCAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать, краниопластика CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать, краниопластика CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать, краниопластика

Пример изготовления форм для литья имплантов

jkns-52-541-g003-lCAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать, краниопластика

Стоматология

3D-печать, снимки КТ/МРТ и сканирования ротовой полости выводит стоматологический бизнес на производственные мощности и самое главное — стоматологические модели, напечатанные на 3D-принтере, в точности повторяют все анатомические данные и исключают человеческий фактор.

Какие преимущества открывает перед стоматологами 3D-печать?

  • хранение всех анатомические данных пациентов в цифровом виде
  • значительно ускорение производства
  • минимизация человеческого фактора, исключение ошибок
  • увеличение объемов производства без увеличения штата сотрудников
  • невероятная точность изготовления

Возможности для стоматологов

Изготовление слепков, проверка прикуса, примерка протезов, изготовление коронок, мостовидовых протезов, гипсовых моделей и уникальных ортодонтических инструментов и конструкций. Можно изготовить цельную челюсть, можно лишь часть, можно разборную модель.

 CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать

Навигационные шаблоны для операций по данным КТ/МРТ

Хирургический шаблон позволяет производить сверхточную постановку зубных имплантатов. Это приспособление, которое надевается на челюстную кость в месте установки имплантата для точного сверления отверстий под имплантаты. Шаблон проектируется с такой точностью, что исключает возможность повреждения сверлом опасных областей, например, альвеолярного нерва, корней зубов или других анатомических образований. Использование шаблона исключаюет возможные осложнения, позволяет избежать таких сложных операций как наращивание кости или операция синус-лифт, облегчает проведение операции имплантации, повышает ее производительность и сокращает операционное время.

CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать

Протезирование

Сложные по форме и строению протезы, а также их составные части можно сделать, благодаря 3D-сканированию, преобразованию файла в 3D-модель и последующей 3D-печати. Такой процесс лечения пациента позволяет решить многие клинические задачи, связанные с протезированием. В данном случае производство зубных имплантантов учитывает индивидуальные особенности анатомии пациента. Протезы получаются максимально индивидуальные, более качественными, безопасными и удобными.

dp-3500-3d-printer CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать

Обучение

С помощью 3D-моделей, сделанных из снимков КТ/МРТ можно создать макеты, наглядные пособия,которые будут служить наглядным пособием для студентов и других обучающихся.

CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать

Если у вас есть необходимость изготовить физическую или CAD-моделель по данным КТ и МРТ, свяжитесь с нами 8 800 550 40 45, info@can-touch.ru или по форме обратной связи:

Политика конфиденциальности и Пользовательское соглашение

Мы принимаем любые форматы

Данные снимки могут находится в различных графических форматах, таких как DICOM и другие. Формат DICOM — это универсальный стандарт для создания, хранения, передачи и визуализации медицинских изображений c теговой организацией. Работая с DICOM-файлами (.dcm) или DICOM-каталогами (DICOMDIR), можно получить 3D-модели любого органа человека, благодаря особенностям этого стандарта.

DICOM (*.dcm, *.dic), GIF files (*.gif), Raw Image (*hdr.), PGM files (*.pgm), Bitmap (*.bmp), TIFF files (*.tif), JPEG files (*.jpeg, *.jpg), DXF files (*.dxf), PNG files (*.png), VRML files (*.wrl).

Сроки выполнения заказа

Для моделирования на основе графических снимков мы используем самые прогрессивные технологии поверхностного моделирования (Surface technology), что позволяет нам  быстро и качественно
создать 3D-модель. Скорость создания модели зависит отсложности задачи, от количества и качества предоставленных графических файлов и в среднем колеблется от 1 до 5 часов. Если 3D-модель требует доработки, то сроки могут быть увеличены в зависимости от объема работы.

3D-печать

Все наши материалы для 3D-печати имеют различные свойства, что позволяет создавать высокоточные прототипы для разных задач в сфере медицинских нужд. Это могут быть прототипы органов и их систем, прототипы скелета, костей, черепа, челюсти. Мы создаем высокоточные прототипы из экологически чистых материалов.

Как это используют врачи на примере перелома бедренной кости взрослого человека

На подготовленную CAD-модель перелома бедренной кости взрослого человека, которая была получена в результате обработки снимков КТ/МРТ, врачом накладывается расчетная сетка, задаются механические свойства металлофиксаторов и костных отломков, нагрузки на бедренную кость, граничные условия и т.д., которые являются основой для дальнейшего моделирования на основе метода конечных элементов (МКЭ). В конечном итоге результатом моделирования может быть количественная оценка смещений, прочностных характеристик системы кость–фиксатор, допустимая микроподвижность, не превышающая заданную травматологом. На изображении показано моделирование системы кость – фиксатор, видно соединение отломков бедренной кости человека с помощью металлофиксатора.

CAD-моделей по данным КТ и МРТ, 3D-печать

Источник

Изготовление трехмерных анатомических моделей с помощью 3D печати на основе томографии30.11.2016

Изготовление трехмерных анатомических моделей с помощью 3D печати на основе томографии

Dr. John Slåstad, хирург-ортопед из Oslo University Hospital Rikshospitalet, Норвегия, использует 3D-печать при операциях на тазобедренном суставе.

После томографии при помощи технологии компании Carestream во время предоперационного планирования изготавливается точная трехмерная модель кости и на ее основании подбирается эндопротез.

Читайте также:  Можно ли пить алкоголь при мрт

Методика успешно используется при корректирующей остеотомии бедра.

По мнению хирурга, на операцию и использованием трехмерной модели уходит вполовину меньше времени. Это облегчает наркоз и его последствия для пациента, облегчает работу хирурга, ассистентов, операционной сестры и анестезиолога. Во время операции ортопед был в восторге, насколько точно подошел подобранный эндопротез. 

Long-bone-osteotomy.jpg
 
При планировании двухполюсного эндопротезирования у больного с коксартрозом делается КТ и с помощью специального программного обеспечения выясняется степень снижения костной плотности вертлужной впадины. Создается детальный план восстановления центра вращения. Также прогнозируется траектория введения и длина винтов для надежного крепления чашки эндопротеза к подвздошной, седалищной и лобковой костям. Учитывается качество кости для выбора оптимального винта. 

3D модель вертлужной впадины

Хирурги проводят планирование операции с анатомической пластиковой моделью полукольца таза. Пробные имплантаты устанавливаются и закрепляются в 3D модели с помощью дрели и винтов. Доктор заранее может потренироваться несколько раз в установке эндопротеза. 

3D модель вертлужной впадины

Методика предоперационного 3D-моделирования используется для сложных случаев.

У 5-ти летнего мальчика по имени Джоджо из деревни близ Мюнхена, Германия, была обнаружена редкая злокачественная опухоль — саркома Юинга. Обычно опухоль локализуется в диафизе длинных трубчатых костей. У Джоджо опухоль располагалась в дистальной части левой бедренной кости и очень близко к эпифизарной пластинке. Поскольку не существует эндопротезов для таких маленьких детей из-за их малых анатомических размеров, обычно выполняется ампутация ноги.

Но хирурги в Мюнхене решили попробовать спасти мальчику ногу. Они разработали план операции с целью резекции опухоли в пределах здоровых тканей и реконструкции костных дефектов с биологическим материалом — сочетание собственной малоберцовой кости и донорской кости. Хирурги запланировали провести операцию без повреждения ростковой зоны, чтобы сохранить естественный рост левой бедренной кости.

Были проведены КТ и МРТ. На основании этих исследований Dr. Ulrich Lenze и Dr. Carolin Knebel, хирурги ортопедического отделения клиники Rechts der Isar (Мюнхен, Германия) и клинический инженер по материализации Antoon Dierckx создали трехмерную модель. После этого сделана 3D-реконструкция донорской кости.

Поиск донора бедренной кости определенного размера был отдельной большой проблемой. Поэтому хирурги были вынуждены использовать плечевую кость взрослого донора, две кости были предоставлены German Institute for Cell and Tissue Replacement (DIZG). С помощью КТ-сканирования донорской кости и программного обеспечения по 3D-моделированию появилась уверенность, что донорская кость должна идеально встать на место дефекта.

3D  

Перед операцией проведено виртуальное предоперационное планирование в 3D.

После точной резекции пораженного сегмента кости при помощи заранее изготовленных 3D-печатных титановыx пластин проведен стабильный остеосинтез аллотрансплантата и остальных костей.

3D

Операция длилась около 8 часов. Родители Джоджо не знали, как успокоиться, пока их сына оперировали. Усилия хирургов были вознаграждены: операция прошла успешно. Руководитель бригады хирургов Professor von Eisenhart-Rothe пришел к выводу, что опухоль была полностью удалена и хирургам удалось сохранить ногу. Если все пойдет по плану и никаких осложнений не произойдет, мальчик будет иметь шанс почти полностью выздороветь и наступать на ногу без ограничений.

У 6-тилетней Хелены была выявлена злокачественная опухоль в левой бедренной кости. Ситуация осложнялась тем, что опухоль располагалась близко к ростковой зоне. При удалении опухолей проводится удаление здоровых тканей на расстоянии не менее 3-х сантиметров в пределах здоровой ткани. Лечение опухоли по всем правилам онкологии означало, что у девочки никогда не будет сгибаться нога в коленном суставе и сама нога не будет расти за счет удлинения бедра. Мама не знала, что ответить ребенку на вопрос «когда я снова смогу танцевать?».

3D

Dr. Gwen Sys, хирург-ортопед из University Hospital Gent и клинический инженер сделали 3D модели. Для этого потребовалось сделать Хелене МРТ и КТ бедренной кости. Программа позволила создать точную копию бедренной кости и разработать план операции. Также были сделаны титановые пластины, идеально прилегающие к трансплантату и здоровой кости.

3D

Маленькой Хелене удалось сохранить коленный сустав. Ей сделали химиотерапию и курс физиотерапии.

3D

Врачам повезло, что несмотря на серьезность ситуации маленький пациент оказался очень настойчивым и веселым.

Перевел Александр Дидковский, компания МосРентген Центр

Источник

29.01.2015

Базовая информация, полученная при проведении КТ, является последовательностью двумерных цифровых изображений. Каждый элемент изображения является функцией рентгенологической плотности объекта исследования в соответствующей точке q (x, y, z), представленной в градациях шкалы серого цвета. Эти изображения сохраняются и передаются в виде серии файлов формата DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine).

Читайте также:  В чем отличие мрт мозга от мрт сосудов головного мозга

Конечно томографические срезы имеют равную толщину (например один срез на миллиметр или 1 градус поворота трубки) и одинаковое количество пикселей на каждый срез. После их упорядочения в диагностическом программном обеспечении (томографическая реконструкция) создается объемный блок, представленный регулярной сеткой вокселей, который характеризуется разной интенсивностью поглощения и отражают структуру объекта исследования в объемном виде.

RAW КЛКТ

Рисунок 1. RAW-CT изображение, полученное с конусно-лучевого компьютерного томографа

Самым простым вариантом графического представления полученной объемной структуры является мультипланарная реконструкция. Программное обеспечение может провести сечения полученного объема под разными углами, создав новые серии гомографичних срезов (реформат) в разных плоскостях. Обычно при мультипланарной реконструкции пересечения проводят в стандартных ортогональных плоскостях: фронтальной, сагиттальной, горизонтальной (аксиальной), однако современное программное обеспечение позволяет осуществлять их в любых плоскостях, в том числе криволинейных. Программное обеспечение позволяет легко перемещаться по изображениям в любой плоскости, контролируя при этом положение среза или произвольно выбранной точки в других плоскостях.

MPR-реконструкция КЛКТ

Рисунок 2. Мультипланарная реконструкция данных КЛКТ: аксиальный, сагитальный, фронтальный и пользовательское сечение пациента. Контроль хирургического вмешательства субантральной аугментации и дентальной имплантации.

Для графического представления отдельных анатомических структур в виде виртуальных трехмерных объектов применяют технику объемного (3D) рендеринга. Для этого оператор определяет пороговые значения рентгенологической плотности (например, те, что соответствуют плотности костной ткани). После этого проводится построение трехмерной модели, соответствующей заданному диапазону рентгенологической плотности. Стандартным математическим алгоритмом, который используют для преобразования набора вокселей на полигональную модель, является метод марширующих кубов (Marching cubes). Для понимания особенностей построения трехмерных изображений рассмотрим алгоритм, применяемый в программном комплексе SIMPLANT.

В основе обработки компьютерного изображения и создания трехмерной модели в этом программном комплексе является выбор диапазона сегментации (Thresholding), который выделяет в отдельную маску пиксели со значением серого в заданном диапазоне. Низкое значение границы диапазона сегментации позволяет выделить мягкие ткани пациента, высокое значение — только твердые ткани (кость, зубы). Изменяя верхнюю и нижнюю границы диапазона сегментации, можно выделять отдельные структуры: губчатый и кортикальный слой, канал нижнечелюстного нерва, орбитальную полость и тому подобное. При выборе диапазона сегментации можно опираться на усредненные данные. Для большей точности можно применить анализ рентгенологической плотности вдоль профильных линий, проведенных через исследуемые структуры.

Специальный инструмент программы SIMPLANT позволяет разделить сегментацию в пределах выбранного диапазона на несколько объектов (масок) и убрать отдельно стоящие пиксели.

Изменяя пороговые значения рентгенологической плотности и методы графической обработки изображения, можно создать сложные, многокомпонентные модели, состоящие из отдельных элементов, которые соответствуют костям, мышцам, дыхательным путям, сосудам и тому подобное. Некоторые модели выделяют разным цветом и изменяют их прозрачность для получения максимально наглядного и простого для восприятия изображения объекта исследования.

3D снимкок областей с разной плотностью

Рисунок 3. 3D реконструкция по данным КЛКТ: костная модель, мягкотканная модель, объемная модель дыхательных путей.

Опыт создания виртуальных моделей по данным томографии свидетельствует, что кости лицевого черепа, которые являются основным объектом исследования в челюстно-лицевой хирургии, — это геометрически сложные, неоднородные образования, содержащие большое количество внутренних полостей. Некоторые элементы анатомических структур имеют размеры, сопоставимые с разрешением современных томографов или меньше. В зависимости от выбранного диапазона сегментации отдельные элементы могут быть объединены или, наоборот, при увеличении порогового значения один элемент анатомической структуры может быть представлен в виде нескольких отдельных элементов. Важное значение в процессе создания виртуальных 3D-моделей имеет предварительная оценка качества томографии, выявление имеющихся артефактов и их устранение в процессе обработки графического изображения.

Программный комплекс SIMPLANT содержит широкую панель инструментов для редактирования модели как на этапе создания маски сегментации, так и непосредственно в режиме 3D. Существует дополнительная возможность сглаживания поверхности, заполнения пустот, а также аппарат булевых операций, что позволяет объединять маски, отделять одну маску от другой и определять участки пересечения различных объектов.

При этом правильное определение границ объекта исследования и создание высокоточной виртуальной трехмерной модели требует точного знания особенностей его нормальной и патологической анатомии, топографических соотношений различных анатомических структур и особенностей представления их изображений на томограмме, особенностей проведения исследования с учетом типа томографа, применяемого причин возникновения артефактов и недостатков томографического изображения.

Продолжение статьи читайте ЗДЕСЬ.

Источник